Mikko Karttunen

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Mikko Karttunen étudie les interactions biomoléculaires à petite échelle. Les résultats de cette recherche contribueront à la découverte de médicaments et à la détermination de cibles thérapeutiques pour diverses maladies. Ils ont d’ailleurs déjà débouché sur la création d’un logiciel gratuit de dynamique moléculaire Cashew qui reproduit d’importantes propriétés de l’eau : http://www.softsimu.net/downloads.shtml

Cette recherche vise essentiellement à comprendre les interactions à l’échelle nanométrique des biomolécules aux interfaces. L’infrastructure de Calcul Canada sert à l’exécution des simulations à grande échelle de dynamique moléculaire. Les Canadiens pourraient bénéficier des résultats de cette recherche enrichissant les connaissances atomistes relatives aux processus biologiques qui contribueront à la création de nouveaux médicaments et à la détermination de cibles thérapeutiques pour quantité de maladies humaines. En alliant les résultats de leurs calculs haute performance et les techniques expérimentales, le professeur Karttunen et son équipe atteignent un niveau de compréhension des biomolécules sans précédent, ce qui pourrait déboucher sur la conception rationnelle de nouvelle biotechnologie. Cette recherche aurait été impossible sans l’infrastructure de Calcul Canada, car les simulations exigent des grappes d’ordinateurs puissants. Les ressources informatiques de pointe pour les calculs haute performance sont essentielles à l’application de la chimie computationnelle sur des systèmes biologiquement pertinents.

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